兩者各有所長。
環境工程：環境科學的一個分支，主要研究如何保護和合理利用自然資源，利用科學的手段解決日益嚴重的環境問題、改善環境質量、促進環境保護與社會發展。是研究和從事防治環境污染和提高環境質量的科學技術。環境工程同生物學中的生態學、醫學中的環境衞生學和環境醫學，以及環境物理學和環境化學有關。由於環境工程處在初創階段，學科的領域還在發展，但其核心是環境污染源的治理。
市政工程：指市政設施建設工程。在我國，市政設施是指在城市區、鎮鄉規劃建設範圍內設置、基於政府責任和義務為居民提供有償或無償公共產品和服務的各種建築物、構築物、設備等。城市生活配套的各種公共基礎設施建設都屬於市政工程範疇，比如常見的城市道路，橋樑，地鐵，比如與生活緊密相關的各種管線：雨水，污水，上水，中水，電力，電信，熱力，燃氣等，還有廣場，城市綠化等的建設，都屬於市政工程範疇。
