過量飲用咖啡的危害首先來自於其中所含的咖啡因，因為咖啡因能興奮神經、刺激血管、加速心跳，過量飲用咖啡會引起竇性心動過速和室性早搏，血壓升高，夜間失眠。短時間內連續飲用3杯咖啡，可出現情緒緊張、憂慮、呼吸短淺等現象；飲用10杯以上，可引起一些中毒症狀，如耳鳴、譫語、視物模糊、快速心律失常、肌緊張、肌震顫等。
芬蘭和美國的研究人員通過調查分析發現，這兩個國家都是消費咖啡最多的國家，其結果是，這兩個國家中患糖尿病的人數也最多。其中，芬蘭人的咖啡消費量居世界之首，該國的糖尿病患者也是世界上最多的。其它北歐國家的咖啡消費量也大，患糖尿病的人數也多。相反，日本人的咖啡消費量在世界上是最少的，糖尿病患者也最少。研究者分析認為，咖啡飲料中含有的咖啡因可以透過胰臟而沉澱到胎兒組織中，尤其是胎兒的肝臟、大腦，使出生後的嬰兒可能患糖尿病。
