水樣的採集和保存應注意事項：測定懸浮物、pH、溶解氧、生化需氧量、油類、硫化物、餘氯、放射性、微生物等項目需要單獨採樣；其中測定溶解氧、生化需氧量和有機污染物等項目的水樣必須充滿容器；pH、電導率、溶解氧等項目宜在現場測定。
水樣採集與保存，是指農田生態系統中的水樣一般有雨水、灌溉水、徑流水和土壤滲漏水等，應根據研究的要求按規定進行採樣與保存。雨水的採集可從氣象站量雨筒中取樣，或用容器放置於露天，待降雨時接收水樣；灌溉水的採集宜在灌水溝渠中進行，或在水庫、山塘、河流、水井等水源處取樣，注意不要在施過肥的稻田中取樣；徑流水可取自測量徑流量設施的出水口；土壤滲漏水可以通過埋設地下排水管或建立排水採集器來採集。
