身體背腹扁平；左右對稱（兩側對稱）；體壁具有三胚層；有梯狀神經系統（在前端有發達的腦，自腦向後並有若干縱行的神經索，各神經索之間尚有橫神經相聯，形成了梯狀結構）；無體腔，有口無肛門。由於扁形動物出現了中胚層，中胚層可以分化形成肌肉層。
本門動物可以分為以下3個綱：1、渦蟲綱：是扁形動物中最原始的類羣，體表被纖毛，腸道較發達，體長5mm至60cm，已知約4000種，多數營自由生活。海洋生活的如旋渦蟲；淡水中生活的如真渦蟲Dugesia（Euplanaria）；少數種類在陸地潮濕土中生活如土笄蛭渦蟲。
2、吸蟲綱：成蟲體表無纖毛，腸道較簡單，通常有口吸盤和腹吸盤等吸附器官。已知約6千種，均營寄生生活，生活史複雜，包含1～2箇中間宿主。如寄生在人體門靜脈內的日本血吸蟲，給人體以極大的危害，此外尚有寄生在人體肝臟的華枝睾吸蟲；寄生在人體肺內的魏氏並殖吸蟲等。
3、絛蟲綱：成蟲體表無纖毛，消化系統包括口和腸等全部退化消失，成蟲一般作長帶狀，由多數節片組成，有吸盤和鈎等附着器官，已知約有3千4百種，全為營體內寄生生活，寄生在脊椎動物的腸道等器官內，為高度營寄生生活的類羣。如豬帶絛蟲和牛帶絛蟲。
