協議是主合同的從屬合同，依附於主合同而成立。沒有主合同，就不會產生補充協議，這是主合同與補充協議的基本關係。所以一般來説，補充協議效力優先於主合同，因為它形成於主合同之後，是對主合同的變更或補充。當補充協議的約定與主合同的約定發生矛盾時，應該以時間在後的約定條款為準執行。補充協議與主合同具有同等效力，而且由於其簽訂時間在後，補充合同的約定與主合同的約定發生矛盾時，應該以時間在後的約定條款為準執行。
法律依據
《中華人民共和國民法典》第464條規定合同是民事主體之間設立、變更、終止民事法律關係的協議。婚姻、收養、監護等有關身份關係的協議，適用有關該身份關係的法律規定;沒有規定的，可以根據其性質參照適用本編規定。
