硝酸鹽的用途是供植物吸收的氮肥，氮元素不僅是氨基酸與蛋白質的主要成分，還可以合成葉綠素，促進光合作用，所以如果植物缺氮就會葉子枯黃。硝酸鈉和硝酸鈣是很好的氮肥。硝酸鉀是制黑色火藥的原料。硝酸銨可作肥料，也可制炸藥。
硝酸鹽對人體健康的損害不亞於農藥。因為硝酸鹽不僅容易誘發糖尿病，對腎臟造成的損害也十分嚴重。腎臟是過濾血液和廢物、排泄水分及鹽分的重要器官，如果人們攝取了高濃度的硝酸鹽，腎臟的負擔加重，容易引起溶血性貧血。除此之外，留存在蔬菜內的硝酸鹽在酶和細菌的作用下，被還原成亞硝酸鹽，進而與人體內的蛋白質類物質結合，生成致癌性極強的亞硝酸胺類物質。
