人類同其他動物一樣，也存在著異色瞳。異色瞳的產生原因如下：
虹膜的顏色是一種多基因遺傳，不同的人種，顏色差別很大。中國人眼睛的褐色是最常見的，有大量的黑色素。人們常說白種人金髮碧眼，白種人眼睛看起來是藍色。但其實不管看起來是藍色還是褐色，都是因為黑色素這一種染料”，虹膜後部及基質內有著高濃度黑色素的時，看起來就是褐色。當虹膜後部黑色素濃度正常，但基質內黑色素很低時，大部分光會被反射，只有少部分光會被吸收，看起來就是藍色，灰色眼睛的原理也一樣，但因為大量膠原沉澱使得光發生了不同型別的散射，所以看起來是灰色。
還有綠色眼睛，費雯麗就長了一雙迷人的綠眼睛，綠色眼睛虹膜後部黑色素較少，但基質內有一些脂褐素和少量黑色素，所以看起來是綠色。我們還見過琥珀色的眼睛，那是因為虹膜基質上方有一層額外的脂褐素。還有很少見的虹膜異色症，也就是說兩隻眼睛顏色不同，比如越獄主角米帥就是左眼淺褐色右眼綠色。這種現象最常見的原因是遺傳。畢竟米帥就是複雜的混血關係啊。
然而，其他因素也會影響眼睛的顏色，比如炎症就可能導致眼睛變色。
