1、抗吞噬作用：莢膜因其親水性，帶正電及其空間佔位、屏障作用，可有效抵抗寄主吞噬細胞的吞噬作用。還可以保護自身免受噬菌體的吸附。
2、黏附作用：莢膜多糖可使細菌彼此間粘連，也可黏附於組織細胞或無生命物體表面，是引起感染的重要因素，具有莢膜的S-型肺炎鏈球菌毒力強，有助於肺炎鏈球菌侵染人體；廢水生物處理中的細菌莢膜有生物吸附作用，將廢水中的有機物、無機物及膠體吸附在細菌體表面上。
3、抗有害物質的損傷作用：處於細菌細胞最外層，莢膜猶如盔甲，可有效保護菌體免受或少受多種殺菌、抑菌物質的損傷，如溶菌酶、補體等。
4、抗乾燥作用：莢膜多糖為高度水合分子，含水量在95%以上，可幫助細菌抵抗乾燥對生存的威脅。
5、當缺乏營養時，莢膜可被利用作碳源和能源，有的莢膜還可作氮源。
