1、接收員工提交的扣除資訊；
2、發放工資辦理全員員額申報；
3、將可扣除金額填至扣繳報告表；
4、辦理扣除計算稅款。
單位在提交專項附加扣除資訊時需要嚴格按月計算預繳稅款，向稅務機關辦理全員全額納稅申報。若員工未及時報送相關資訊，可在以後月份補報，單位在剩餘月份發放工資時補釦，不影響納稅人享受專項附加扣除。
法律依據：
《國務院關於印發個人所得稅專項附加扣除暫行辦法的通知》第二十五條
納稅人首次享受專項附加扣除，應當將專項附加扣除相關資訊提交扣繳義務人或者稅務機關，扣繳義務人應當及時將相關資訊報送稅務機關，納稅人對所提交資訊的真實性、準確性、完整性負責。專項附加扣除資訊發生變化的，納稅人應當及時向扣繳義務人或者稅務機關提供相關資訊。前款所稱專項附加扣除相關資訊，包括納稅人本人、配偶、子女、被贍養人等個人身份資訊，以及國務院稅務主管部門規定的其他與專項附加扣除相關的資訊。本辦法規定納稅人需要留存備查的相關資料應當留存五年。
