正常人的癌症指標也會改變，有許多因素可以影響腫瘤標誌物的指標，如飲酒、睡眠不良和補充食物，癌症的診斷必須通過病理檢查來確定。
胰腺癌、肝膽和胃腸道疾病時血中CAl9—9的水平可明顯升高。其陽性率胰腺癌為85％～95％，膽囊癌和膽管癌為85％左右，胃癌、結腸癌為40％，直腸癌為30％～50％；但無早期診斷價值，對早期病人的敏感度僅為30％。血清NSE是神經元和神經內分泌細胞所特有的一種酸性蛋白酶，神經內分泌腫瘤的特異性標誌，如神經母細胞瘤、甲狀腺髓質癌和小細胞肺癌(70%升高)，可用於鑑別診斷、病情監測、療效評價和復發預報。
