1、這三種疫苗能夠預防HPV病毒型別不同，二價疫苗能預防HPV16、18型的人乳頭瘤病毒感染；四價疫苗除了能預防上述這兩種型別的病毒以外，還能夠預防6、11型的低危的人乳頭瘤病毒感染；九價疫苗則更全面一些，除了能夠預防6、11、16、18等上述的高危型HPV病毒感染以外，還可以預防31、33、45、52、58型人乳頭瘤病毒。
2、這三種疫苗的推薦接種年齡不同，二價疫苗的推薦接種年齡為9到45歲；四價疫苗的推薦接種年齡為20到45歲；九價疫苗的推薦接種年齡為16到26歲。
人乳頭瘤病毒：
人乳頭瘤病毒是一種屬於乳多空病毒科的乳頭瘤空泡病毒A屬，是球形DNA病毒，能引起人體面板黏膜的鱗狀上皮增殖。表現為尋常疣、生殖器疣（尖銳溼疣）等症狀。 隨著性病中尖銳溼疣的發病率急速上升和宮頸癌、肛門癌等的增多，人乳頭瘤病毒（hpv）感染越來越引起人們的關注。
