冬季修剪亦稱休眠期修剪，以落葉後至萌芽前進行為宜，在乾旱寒冷地區，嚴冬修剪易出現凍害，故可推遲到春季萌芽前進行。石榴樹冬剪應抓住如下幾個技術要點：
大枝的處理。要按照三稀三密的原則進行三主枝及側枝間彼此要保留80-100釐米的距離，以利於小枝有著生的空間。主、側枝間距離小時，可疏大枝或拉開大枝。
小枝的處理。主側枝間距拉開後，用疏剪的方法使小枝在樹冠上的分佈呈上稀下密、外稀里密的狀態。要求小枝間互不交叉、互不重疊和留有餘空。留有餘空的目的是要留出萌芽後新梢生長所需要的空間，從而避免新梢的交叉和重疊。
結果母枝的處理。在疏剪的整個過程和疏剪後，首先要識別花芽和著生花芽的結果母枝，儘量多保留有花芽的結果母枝，並在其周圍保留3-5個營養枝。如果結果母枝過多，可再疏去一些細小的枝組，如果原樹枝條過密，沒有形成花芽或花芽很少，那就只修剪到小枝互不交叉、重疊和留有餘空就可以了。
