在《火影忍者》中佩恩的輪迴眼並不是自己所有的，而是他在被控制之後施術者的瞳力投影出來的。
佩恩的輪迴眼既可以在前面看著敵人，又可以在後面監視敵人，此外，前面的佩恩也可以看到後面的佩恩所看到的一切。
輪迴眼是《火影忍者》中衍生的三大瞳術，被稱為“掌控生死之眼”，它起源於神樹查克拉果實的究極瞳術。
輪迴眼共分為紫色、紅色、黃色三種，這是寫輪眼的最終形態，但是這種眼睛必須因陀羅和阿修羅的力量融合，引出六道之力，才可獲得新的瞳術“輪迴眼”。
第一個開啟輪迴寫輪眼的是大筒木輝夜，第二個則是宇智波斑。而輝夜長子大筒木羽衣在出生之後便擁有了查克拉和輪迴眼。
據統計，擁有輪迴眼的人一共有八個人，分別是大筒木輝夜、大筒木桃式、大筒木浦式、大筒木羽衣、宇智波斑、長門、宇智波帶土、宇智波佐助。
此外，佩恩是曉組織首領長門用輪迴眼能力所控制的六具屍體，佩恩是因為長門行動不便所製造出來的代替物，他的主體為長門摯友彌彥，能力來自長門。佩恩沒有自我意識，所以的意識來自於幕後操縱者。
