錦州市辦理港澳通行證方法如下：
1、提交申請。申請人可先在網上提前預約申請，或直接到現場提出申請。
2、數碼照相。申請人需要提交本人數碼照片兩張，可直接在現場進行拍照。
3、採集指紋。申請人在工作人員的指引下進行指紋採集或者核驗指紋，16週歲以下的申請人是否採集指紋根據其監護人的意見確定，採集後拿號等待辦理。
4、受理申請。工作人員對申請人提交的材料進行初審，並出具繳費單給申請人。
5、繳納費用。申請人到指定視窗繳納辦證及簽註所需的費用，制證費用80元，簽註費用以簽註型別而定，並領取回執單。
6、製作證件。受理申請後，由省公安機關出入境管理機構負責製作電子港澳通行證，並將製作好的證件送回接受申請的出入境管理機構。
7、發放證件。申請人在制證完成後，到辦理的出入境管理機構領取證件;若選擇快遞形式收件的話，只需等候快遞人員上門進行簽收即可。
