通常情況下，保險公司規定，在保險單載明的保險金額內，自燃損失險的賠償需按照保險車輛的實際損失計算賠償，一般包括三個方面，即全部損失賠償、部分損失賠償、施救費用賠償。其中，全部損失的，自燃險應在保險金額以內按出險時保險車輛實際價值計算賠償；部分損失的，則在保險金額以內按保險車輛的實際損失計算賠償。
至於車輛自燃時的施救費用，需要在保險金額內按實際支出計算賠償。然而，不管是全部損失賠償、施救費用賠償，還是部分損失賠償，自燃損失險每一次的賠償都要實行20%的絕對免賠率。當然，若車主購買了附加險的不計免賠險，則可以將20%的絕對免賠率轉嫁給保險公司，從而給自己降低經濟損失。
在保險期間內，保險車輛在使用過程中，因本車電器、線路、油路、供油系統、供氣系統、貨物自身發生問題、機動車運轉摩擦起火引起火災，造成保險車輛的損失，以及被保險人在發生本保險事故時，為減少保險車輛損失所支出的必要合理的施救費用，保險人負責賠償。
