長期戴美瞳的危害有眼睛抵抗力下降：美瞳會使角膜無法接觸空氣，眼睛會因缺氧而產生類似於人體“高原反應”的情況，無法正常代謝、抵抗力下降。
引起很多眼病,如角膜炎，結膜炎：長期戴美瞳可引起很多眼病，如角膜炎，結膜炎等等，美瞳佩戴最大問題就是衛生，日常的佩戴、清洗都有可能使鏡片感染，從而引發眼睛炎症，因此，佩戴美瞳除了要注意時間問題外，保養也是必不可少的。
磨損角膜：磨損角膜，無法接受矯治。美瞳磨損角膜，可能造成角膜上皮脫落或穿孔的嚴重後果。部分美瞳凹度與角膜凸度不符，不規則磨損角膜，引起角膜潰瘍，造成了不可逆轉的視力下降，即使治療後也會在角膜上留下白斑。因此，選擇美瞳時首先要以正規品牌為主，然後注意正確的佩戴方法與時間才能儘量減少鏡片對眼睛的傷害。
