軟體工程專業是南開大學的重點科目之一，位於全國前列，是比較好的專業。學院目前已經建立了軟體工程本科、軟體工程碩士，同時享有計算機軟體與理論、模式識別與智慧系統工學碩士學科，以及計算機應用技術博士學科， 形成了較為完整的人才培養體系。
南開大學軟體學院於2001年8月籌建，2002年1月正式成立，是首批經國家教育部、國家計委批准的國家示範性軟體學院。軟體學院充分利用南開大學的綜合資源，以創 “ 國際先進、國內一流 ” 的軟體學院為目標，秉承南開大學 “ 允公允能，日新月異 ” 的校訓，堅持求真務實、開拓創新、共享合作，為國家培養經濟結構戰略調整和軟體產業發展所急需的高層次軟體人才。
