元朝滅亡的主要原因有以下幾點：
1、殘元政權的滅亡：黃金家族，也就是忽必烈家族的殘元政權喪失了在蒙古人中至高無上的地位，以至於大多數蒙古部落宣佈脫離它而自立，合法的蒙古帝國大汗不復存在了，蒙古各部又回到了爭奪蒙古帝國大汗寶座的紛爭當中。
2、永不停歇的戰爭機器，戰爭打的就是錢和糧：無論元朝是建立於1206年的蒙古汗國，還是1271年的大元，到1368年滅亡之前，整個元朝沒有戰爭記錄的年份僅22年。
3、賦稅繁重造成貪汙腐敗：元朝的賦稅非常繁重，這更是促成貪汙腐敗的要素之一，元朝嚴重的腐敗使得各地農民起義迭起，勢如破竹，僅山東、河北地區，就有三百餘起農民暴動，蒙古統治者比鮮卑統治者的殘暴程度更加嚴重。
4、內部奪權，暗爭暗鬥：元朝頻繁地更迭帝位，無形中削弱了其內部的凝聚力，和各派系勢力，從而引致了內亂。
5、群雄紛起爭汗位：殘元的滅亡，使明朝失去了政治上的敵人，蒙古已經成為了“邊患”，群雄紛起，已不再是前一王朝殘餘勢力。
6、黃金家族的復辟：滿都海賽音可敦是一個了不起的女人，滿都海賽音可敦達對延汗進行撫養和保護，還在1470年宣佈他為大汗。最為難得的是，滿都海賽音可教作為女人率領軍隊打敗了衛拉特人，將他們徹底趕出了蒙古中東部地區。為達延汗日後的統治奠定了基礎。
