一百萬住房公積金貸款和商業住房貸款相比，因為公積金貸款執行央行貸款基準利率，而在央行貸款基準利率當中，五年以上公積金貸款年利率為3.25%；商業貸款以LPR為定價基準加點形成（不同地區、不同銀行規定的基點數不同），假設辦的是二十年房貸，商貸執行的利率是4.65%加85基點（一個基點等於0,01%），也就是5.5%，採取的都是等額本息還款法。
如此一來，一百萬公積金貸二十年要繳納的總利息就是：1000000－[1000000×3.25%/12×（1+3.25%/12）^240]÷[（1+3.25%/12）^240－1]×240=361269.83元。
一百萬商貸二十年要繳納的總利息則是：1000000－[1000000×5.5%/12×（1+5.5%/12）^240]÷[（1+5.5%/12）^240－1]×240=650929.54元。
由此可見，商貸比公積金多了：650929.54－361269.83=289659.71元利息。也正是因為住房公積金貸款利率低於商業性住房貸款利率，所以大部分人更願意辦理公積金貸款，還款負擔更輕。
