被病毒感染的細胞通過信使囊泡將病毒的抗原資訊傳到細胞膜表面。抗原是指能引起抗體生成的物質，是任何可誘發免疫反應的物質。外來分子可經過B細胞上免疫球蛋白的辨識或經抗原呈現細胞的處理並與主要組織相容性複合體結合成複合物再活化T細胞，引發連續的免疫反應。
同種異體抗原：有兩大類，一類是紅細胞血型抗原，包括A、B、O血型抗原，Rh血型抗原等。不同血型間相互輸血，可引起嚴重的輸血反應；另一類是存在於人類白細胞細胞膜上的人類白細胞抗原（HLA），又稱主要組織相容性抗原。它們與血型抗原一樣，也是由遺傳決定的，受染色體上的基因控制。不同的個體（同卵雙生者除外）其組織細胞的組織相容性抗原絕大多數不完全相同，因此，在同種異體進行面板或臟器移植時，常因供者移植物中存在受者所沒有的抗原成分，刺激受者產生對移植物的免疫反應，導致移植物受到排斥而壞死脫落。
