北京協和醫學院是國內最頂尖的醫科大學，與中國醫學科學院院校一體，科研實力雄厚，被譽為中國醫學殿堂。學校一直以來都是堅持小規模招生、高層次培養、高質量輸出，所以每年的本科招生一般就在一兩百人左右而已。2006年9月，與清華大學實行緊密合作辦學，同時使用“北京協和醫學院--清華大學醫學部”作為第二名稱，學校仍為獨立法人單位。院校設有18個研究所、7所臨床醫院、6所學院、1個研究生院
本科階段只招兩個專業——臨床醫學專業和護理學專業。其中臨床醫學專業為八年制，納入清華大學總招生計劃，在填報志願時應報清華大學臨床醫學專業，並可同時報清華大學其他理工類專業。順利畢業之後，授予醫學博士學位，含金量在國內醫學界絕對超高
