1、清塘消毒。就是在魚、蝦養殖池經清淤修整後，用生石灰加水溶化後趁熱全池潑灑。池內留水6～10釐米深，每平方米水面用生石灰85～110克，水深1米時每平方米水面用生石灰80～400克，24小時後池水的pH值在11左右，可迅速清除野雜魚蝦、大型水生生物、寄生蟲和細菌等。這種消毒方法比較徹底，一般是在下魚苗前進行，重在清除魚塘裡有害生物，避免魚苗的死亡與侵害。
2、魚種消毒。魚種放養前要進行消毒，可用一定濃度的食鹽水或藥水浸泡魚體，以殺滅寄生在魚體上的病菌和寄生蟲，具體浸泡時間視水溫高低、藥物濃度、魚種體質而定。
