健康證不是全國通用，在本省通用。一般來說是以省、自治區或直轄市劃分的，所以市、縣衛生行政部門所出具的健康證在本省內沒問題，但跨省時因為每個地方法規的具體執行不同，可能產生偏差。
《中華人民共和國傳染病防治法》第五條
各級人民政府領導傳染病防治工作。縣級以上人民政府制定傳染病防治規劃並組織實施，建立健全傳染病防治的疾病預防控制、醫療救治和監督管理體系。
第六條
國務院衛生行政部門主管全國傳染病防治及其監督管理工作。縣級以上地方人民政府衛生行政部門負責本行政區域內的傳染病防治及其監督管理工作。縣級以上人民政府其他部門在各自的職責範圍內負責傳染病防治工作。軍隊的傳染病防治工作，依照本法和國家有關規定辦理，由中國人民解放軍衛生主管部門實施監督管理。
