眼藥水開封以後要在一個月之內滴完，否則藥液就會變質或失去藥效，用不完也要扔掉。眼藥水的保質期一般是指在陰涼、乾燥環境下並且沒有開封的情況下可以儲存的時間。開封過的眼藥水與空氣接觸後有可能被汙染、變質。
眼睛比身體其他部位都要敏感，如果把過期變質的眼藥水滴在眼睛裡，不但達不到治療效果，還可能引起細菌感染。防腐劑的累積可以引起眼睛乾澀症狀加重，甚至有些人用了含激素的滴眼液，可能會引起眼壓升高，等等諸如此類的問題出現，所以眼科醫生不建議長期（超過一個月）使用眼藥水。
以往每種眼用製劑（包括各種抗生素類眼藥水），在生產時均添加了抑菌劑（亦稱防腐劑），但正因為抑菌劑本身也會對眼組織細胞產生作用，新增量若超過一定濃度，對眼組織細胞同樣具有一定損害作用，故國外目前已逐步轉軌生產一次性使用的眼用製劑，以解決這對矛盾。由於價格因素，國內則以規定啟用後的時效（一個月）來確保使用者的安全。
