熒游標記的多肽是用來檢測目標蛋白的活性，並將其發展的高通量活性篩選方法應用於疾病治療靶點蛋白的藥物篩選和藥物開發（例如，各種激酶、磷酸酶、肽酶等）。熒游標記是利用熒光物質共價結合或物理吸附在所要研究分子的某個基團上，利用它的熒光特性來提供被研究物件的資訊。
熒游標記的無放射物汙染，操作簡便等優點，使得熒游標記物在許多研究領域的應用日趨廣泛。熒游標記物質在蛋白的功能研究、藥物篩選等領域也有著廣泛的應用。熒游標記是將熒光基團共價連線到蛋白、核酸等分子上的過程。通常使用能夠選擇性地與目標分子上存在的功能基團反應的熒光素基團衍生物來完成這樣的過程。最常見的標記過的分子是抗體，經常使用標記過的抗體來檢測特定的目標分子。
