狗真菌感染通常按感染的部位分為淺表真菌感染和深部真菌感染，前者多見於一些面板病，而後者多見於一些內臟器官感染。根據感染的具體系統不同，真菌感染疾病也分為面板胃腸道真菌感染、泌尿系統真菌感染以及內臟器官真菌感染等，通常骨骼和肌肉因為真菌感染的病例非常少見。因此當狗狗感染了真菌性面板病，那麼需要外用抗真菌的藥物。如果是胃腸道出現真菌感染，通常需要內服抗真菌的藥物。泌尿系統或者生殖系統引起真菌感染，也通常需要通過口服抗真菌的藥物進行積極治療。但是由於這些抗真菌藥物對肝的損傷比較大，如果要連續用藥的話需要監測肝功。
