上海主要有三所醫科大學，分別如下：
上海交通大學醫學院：由中華人民共和國教育部、中華人民共和國衛生部和上海市人民政府共建。上海交通大學醫學院前身是由聖約翰大學醫學院、震旦大學醫學院、同德醫學院於1952年全國高等學校院系調整時合併而成的上海第二醫學院；1985年，更名為上海第二醫科大學。上海中醫藥大學：創辦於1956年，是我國首批建立的四所中醫高等院校之一，學校集教學、醫療、科研於一體，專業設定齊全，師資力量雄厚，綜合實力位居全國中醫院校前列，下設16個二級學院。中國人民解放軍第二軍醫大學：創建於1949年9月，1951年定名為“中國人民解放軍第二軍醫大學”，隸屬中國人民解放軍總後勤部。
