兩個健康碼都是一樣的，從定位上來說支付寶的健康碼是國家一級的，因為支付寶在國務院辦公廳電子政務辦指導下建立全國統一的疫情防控健康碼系統。而微信主要是與國家資訊中心聯合推出“健康碼”的標準，並非建立全國統一的健康碼系統，所以相比較而言支付寶定位更高。但是兩者效用是一樣的，可以通過支付寶也可以通過微信申領自己的健康碼。
健康碼是以真實資料為基礎，由市民或者返工返崗人員通過自行網上申報，經後臺稽核後，即可生成屬於個人的二維碼。該二維碼作為個人在當地出入通行的一個電子憑證，實現一次申報，全市通用。健康碼的推出，旨在讓復工復產更加精準、科學、有序。
