由蘇門答臘島、加裡曼丹島、爪哇島、菲律賓群島等2萬多個島嶼組成，主要的島嶼有印度尼西亞的大巽他群島、小巽他群島、摩鹿加、伊裡安，菲律賓的呂宋、棉蘭老、米沙鄢群島等等。
馬來群島島嶼分屬於印度尼西亞、菲律賓、馬來西亞。汶萊和巴布亞紐幾內亞等國，其中包括印度尼西亞13600多個島嶼和菲律賓約7100個島嶼。
馬來群島稱東南亞島嶼區，也叫南洋群島，是世界上面積最大的群島。它位於亞洲東南部太平洋與印度洋之間遼闊的海域上，沿赤道延伸6100公里，南北最大寬度3500公里，總面積約243萬平方公里，約佔世界島嶼面積的20％。馬來群島位於三大板塊交界處，根據板塊的運動方向，馬來群島中的菲律賓群島及其外側海溝是太平洋板塊與亞歐板塊相撞形成的，馬來群島中的大巽他群島和努沙登加拉群島及其外側的深海溝則是印度洋板塊和亞歐板塊相撞形成的。
