國家級的研究院(所)主要有： 中國科學技術資訊研究所、中國科學院國家天文臺南京天文光學技術研究所、中國科學院金屬研究所、國家體育總局體育科學研究所、中國科學院生物物理研究所、中華人民共和國民政部中國地名研究所、國家發展和改革委員會能源研究所、國家計委產業發展研究所、中國科學院研究院等。
中國科學院研究院在學術界，稱其為科學試驗的研究機構。是大學之後的進階教育研究機構，一般設於大學中，以“某大學某研究生院”的形式存在，也有獨立設立者；
中國科學技術資訊研究所是在敬愛的周總理親自指示和關懷下於1956年10月成立的，是國家科學技術部直屬的國家級公益性科技資訊研究機構；
中國科學院金屬研究是新中國成立後中國科學院新建立的首批研究所之一，建立者是我國著名的物理冶金學家李薰先生。經老一輩科學家和幾代人的不懈努力，金屬研究所已經發展成為我國享譽海內外的材料科學與工程研究重要的研究基地。
