塔爾寺是宗喀巴大師羅桑扎巴誕生地。宗喀巴大師早年學經於夏瓊寺，16歲去西藏深6年後，其母香薩阿切盼兒心切，讓人捎去一束白髮和一封信，要宗喀巴回家一晤。宗喀巴為學佛教決意不返，給母親和姐姐各捎去自畫像和獅子吼佛像1幅，並寫信“若能在我出生地用十萬獅子吼佛像和菩提樹修建一座佛塔，就如與我見面一樣”。明洪武十二年，香薩阿切在信徒們支援下建塔，取名“蓮聚塔”。此後塔多次改建維修，萬曆十年，三世達賴向仁欽宗哲堅贊及當地申中、西納、祁家、龍本、米納等藏族部落昂索指示擴建塔爾寺，賜贈供奉佛像，並進行各種建寺儀式。從此，塔爾寺發展很快，先後建成達賴行宮、三世達賴靈塔殿、九間殿、依怙殿、釋迦殿等。經四世達賴指示，萬曆四十年正月，正式建立顯宗學院，講經開法，標誌著塔爾寺成為格魯派的正規寺院。這就是塔爾寺的由來。
