註冊會計師審計意見有四種，分別是：無保留意見審計報告；保留意見審計報告；否定意見審計報告；拒絕表示意見審計報告。無保留意見審計報告即註冊會計師在順利實施了必要的審計之後，認為被審計單位會計報表的編制合法，在所有重大方面公允地反映了被審單位的財務狀況，會計處理方法遵循一貫性原則。一般情況下，無保留意見審計報告表明公司報表的可靠性較高。保留意見審計報告即註冊會計師經過審計之後，承認已審計單位會計報表，從整體來說，是公允的，但在個別的重要會計事項持保留意見。否定意見審計報告即註冊會計師認為被審單位會計報表嚴重失實或會計處理方法的選用嚴重違反有關法規。否定意見的審計報告說明公司的報表無法被接受，其報表已失去其價值。拒絕表示意見審計報告即註冊會計師在審計過程中，由於受到種種限制，不能實施必要的審計程式，無法對會計報表整體反映發表審計意見。拒絕表示意見的審計報告說明公司經營中已出現重大問題，報表基本不能用。
