在三星S9的桌面找到【應用程式】並點選進入，在應用程式中點選右上角，點開後會發現【隱藏應用程式】這一選項，點選後勾選需要隱藏的應用程式，最後點選完成操作即可。三星S9隱藏應用程式後，能夠讓手機桌面顯示更加簡潔，並且三星S9還能夠隱藏鎖定桌面通知，免受訊息打擾。
其實三星S9能夠隱藏應用程式和三星S9的系統有關係，三星S9搭載基於Android8.0深度定製的SamsungExperience9.0系統，並整合三星自家安全技術Knox3.1。內建Bixby智慧助手，同時為國內使用者提供各方面的本土化功能。無論是圖示的設計風格，還是UI的介面元素，都是和上代S8系列的風格保持高度一致。不過三星S9的新系統的應用圖示多了一些光感元素，和機身的時尚外觀形成絕妙的搭配。
