《雷神3》片尾有兩個彩蛋。
第一個彩蛋：錘哥帶著自己星球的人民坐著飛船離開了阿斯加德，當洛基還在跟雷神索爾商量著去地球的事情的時候，突然在自己飛船的身後出現了一條更大的飛船，隨後彩蛋結束。這是漫威第一階段最終大boss滅霸的飛船，滅霸在漫威漫畫裡可是一個超強的反派，他可以輕鬆打敗美隊等人。至於為什麼滅霸會找到索爾他們的飛船，有網友分析，是因為洛基在該片中拿走了宇宙魔方（片中有預示，在洛基燒燬火人頭盔時看了一眼宇宙魔方），然後滅霸有探測到魔方的能力，所以就追隨而來。此彩蛋緊接著《復仇者聯盟3》的劇情。
第二個彩蛋：索爾到了薩爾星球，被當做了用來打鬥的玩物，但是最終還是帶領著囚犯們逃了出來，片尾第二個彩蛋就是說的高天尊在自己的飛船掉下來，然後發現薩爾星球已經被囚犯解放了，於是自嘲了一番。
