首先，gis是一種特定的十分重要的空間資訊系統，而gps全球定位系統是確定空間的一個點，是空間的一個座標值。gis是在計算機軟、硬體系統支援下，對整個或部分地球表層（包括大氣層）的有關地理分佈資料進行採集、儲存、管理、運算、分析、顯示和描述的技術系統。而gps是通過太空中的24顆GPS衛星來完成的。最少需要其中3顆衛星，就能迅速確定在地球上的位置。
其次GIS具有一定結構和功能，是一個完整的系統。GIS與其他系統不一樣的地方在於它擁有空間資訊，可以給予這些空間資訊做地理分析，這是其他系統所做不到的。而GPS是一箇中距離圓形軌道衛星定位系統，可以為地球表面絕大部分地區提供準確的定位和高精度的時間基準。
總的來說，gis和gps的區別還是比較多的，其中最主要的區別是一個為模擬、一個為定位，而gps是gis資料的重要來源，gis是用來管理空間資料的，將GPS連線到GIS上以後可以在GIS系統裡實時觀看。
