1、製作方法不同：臭豆腐要配滷，也就是能夠讓它發臭的滷汁，然後通過浸泡發酵，再通過晾乾才變成臭豆腐；而腐乳是用大豆、黃酒以及酒麴、食鹽等製作而成的。
2、營養價值不同：雖然它們都屬於豆製品，但是相對來説腐乳的營養價值會更高一些。臭豆腐由於它會有專門發酵的一個發臭的滷汁在裏面，所以相對來説會含有一定的不健康的物質，當然在符合標準的情況下是不會對我們的身體有任何損害的。
3、吃法不同：一般吃臭豆腐有幾種，一種是將它紅燒，一種是清蒸，放上一些辣椒，還有就是炸臭豆腐或者是香煎臭豆腐，上面撒上一些調味料，吃起來味道鮮美；而腐乳在醃製的時候就已經放入了各式的調味料了，所以就可以直接食用，還可以加入麻油提香。
