三九天艾灸注意的事項有四個，第一是成人一般貼藥時間以30到60分鐘為宜，小孩時間酌減，如3歲兒童約15到30分鐘，以面板感受和耐受灼熱水平為察看指標，避免灼傷面板；
第二是孕婦不宜天灸，月經期婦女不宜貼藥，體溫超過38的患者不可天灸，二歲以下嬰兒慎貼藥，但個別嬰幼兒因病情需要者，建議貼藥時間不宜超過10分鐘；
第三是貼藥後面板出現紅暈屬正常現象，可外塗面板軟膏以減緩不適症狀，如貼藥時間過長引起水皰，應保護創面，避免抓破感染，必要時前來醫院處理或搽燙傷軟膏，並注意飲食控制；
第四是為鞏固療效，避免相關不良反應，天灸期間應注意清淡飲食，不宜嗜吃生冷，以防損傷正氣影響療效。
