環境工程專業是在原水文地質學與工程地質學專業基礎上創辦發展起來的。1996年招收環境科學專業本科生，2001年招收環境工程專業本科生，2004年獲得“環境工程”碩士學位授予權，2006年申請到工程碩士專業學位點。經過多年的發展，逐漸形成了具有專業特色和明顯地域特色的實踐教學環節，即包含西北乾旱區內陸石羊河流域的水環境問題、植物生態系統、戈壁、沙漠生態環境問題;沙漠綠洲的形成演化及其環境效應；乾旱區礦山開採引起的環境問題及工業城市環境問題；生態環境保護措施、土地荒漠化及汙染土地治理技術以及工業“三廢”汙染防治技術等具有明顯西北乾旱區地域特色的野外實踐教育環節。
