公元1294年，世祖忽必烈崩。“傳國玉璽”忽現於大都，叫賣於市，為權相伯顏命人購得。伯顏曾將蒙元收繳各國之歷代印璽統統磨平，分發給王公大臣刻制私人印章。傳國玉璽亦恐在其中而遭不測。公元1368年，朱元璋在建康稱帝，號大明，改元洪武。繼而北伐，蒙古元廷棄中原而走漠北，繼續馳騁於萬里北疆。明初，太祖遣徐達入漠北，窮追猛打遠遁之殘元勢力，其主要目的便是索取傳國玉璽，然最終還是無功而返。明清兩代，時有“傳國玉璽”現身之鼓譟，然皆附會、仿造之贗品。至清初時，紫禁城藏御璽三十有九，其中一方即被稱作“傳國玉璽”。而乾隆時，清高宗皇帝頗好考據，欽定其為贗品。但權且以假當真，聊以充數，亦無深究者。民國成立，清廷退位，但依優待條件，仍盤踞紫禁城而稱孤道寡。公元1924年11月，末代皇帝溥儀被馮玉祥驅逐出宮，此“傳國玉璽”復不見蹤影。當時馮部將領鹿鍾麟等人曾追索此鑲金玉璽，至今仍無下文。
