瀚海星雲是中國高校最早自覺實行實名制的BBS之一，也是教育網內較早開辦的高校官方BBS之一。1996年1月6日開站，首任站長是中國科技大學92級計算機系學生張煥傑採用的是臺灣中華工學院資訊工程系學生陳紹俊，郭耿言蔡智強開發的PowerBBS系統2.2版，此後科大學生朱朝陽，蕭鎮等對其做了很多修改，成為2.4a版。
2002年7月16日0時，瀚海星雲實現了由PBBS到FBBS的過渡，過渡期間很多學生徹夜不眠爆發了搶注惹眼ID的狂潮。該站的老網蟲熱衷於使用Telnet方式上線發表文章，灌水搶號是他們認為比較便捷的方式，FireBirdBBS系統穩定後又推出了可供web瀏覽的版本，現在web瀏覽的使用者越來愈多。
