在建築業“營改增“的初期，從不增加施工企業稅收負擔的角度出發，可以根據專案開票的不含稅金額的3%預徵(專用發票仍然是根據建築業一般納稅人的適用稅率開具)。
在建築業、房地產業“營改增“之後，增值稅應該是由國家稅務機關征收，因此建議稅務機關根據建築業、房地產業的特點，仍然實行專案管理。其實在抓好了建築業專案管理的同時，也就抓好了房地產開發企業的專案管理。
同時規定，施工企業在專案竣工驗收之後的“某一規定時間”(如90天、180天)之內，必須進行專案的增值稅清算。
建築業“營改增”之後，應該不再存在“雙包工程”與“清包工程”之分，所有工程材料都應該由建築施工企業採購並取得建築材料發票(前提是滿足房地產開發企業對採購材料品質要求)。
