檢察院的自偵案件的批捕由誰決定

逮捕仍然是檢察院批准。對於屬於檢察院管轄的刑事偵查案件，檢察院內部的刑事偵查機構應按照《刑事訴訟法》中所對公安機關偵查刑事案件的相關規定執行，對於犯罪嫌疑人認為需要逮捕的，仍應報檢察院內部的批捕科來要求批准逮捕，由檢察院作出批准逮捕的決定後，再交由公安機關執行逮捕。

【法律依據】

《刑事訴訟法》第八十條，逮捕的許可權劃分

逮捕犯罪嫌疑人、被告人，必須經過人民檢察院批准或者人民法院決定，由公安機關執行。