1、酶製劑的來源，有微生物、動物和植物，但是，主要的來源是微生物。由於微生物比動植物具有更多優點，因此， —般選用優良的產酶菌株，通過發酵來產生酶。為了提高發酵液中的酶濃度，選育優良菌株、研製基因工程菌、優化發酵條件；
2、酶的分離提純技術是當前生物技術“後處理工藝”的核心。採用各種分離提純技術，從微生物細胞及其發酵液，或動、植物細胞及其培養液中分離提純酶，製成高活性的不同純度的酶製劑，為了使酶製劑更廣泛地應用於國民經濟各個方面，必須提高酶製劑的活性、純度和收率，需要研究新的分離提純技術；
3、和細胞固定化研究是酶工程的中心任務。為了提高酶的穩定性，重複使用酶製劑，擴大酶製劑的應用範圍，採用各種固定化方法對酶進行固定化，製備了固定化酶，如固定化葡萄糖異構酶、固定化氨基醯化酶等，測定固定化酶的各種性質，並對固定化酶作各方面的應用與開發研究。
