管理不善造成的損失，如果屬於計量收發差錯和管理不善等原因造成的存貨短缺，應先扣除殘料價值、可以收回的保險賠償和過失人賠償，將淨損失計入管理費用；如果屬於然災害等非常原因造成的存貨毀損，應先扣除處置收入（如殘料價值）、可以收回的保險賠償和過失人賠償，將淨損失計入營業外支出。
正常損失，指的是增值稅一般納稅人購進的貨物或應稅勞務在生產經營過程中的正常損耗，也就是合理損耗。除了非正常損失之外的損失都屬於正常損失，可以正常抵扣進項。按照最新的會計規定，非正常損失只有一項，即因管理不善造成貨物被盜竊，發生黴爛變質等損失。其他非正常損失和自然災害損失新條例都規定不再屬於非正常損失的範圍。
