在《口袋妖怪》遊戲中，復刻水躍魚在石之洞窟的無底譚中進行捕捉，由於復刻水躍魚非常稀有，所以捕捉概率只有百分之五。具體的劇情如下：
1、在執行捕捉復刻水躍魚的任務時，首先需要打敗枯葉市電系道館中的所有妖怪，打完以後可以獲得聖安努號的船票。
2、根據地圖上的提示，按照路線登上聖安努號輪船，聖安努號輪船會將玩家帶到石之洞窟。
3、在石之洞窟的入口處首先打敗守護關卡的蛟龍，然後即可進入石之洞窟。
4、然後在石之洞窟中找到無底譚，進入無底譚後使用噴霧劑可以提高遇見覆刻水躍魚的概率。
5、若遇到復刻水躍魚，玩家在與復刻水躍魚經過8個回合的相互攻擊後即可將其收服，若沒有遇見覆刻水躍魚，可將無底譚中的寶珠收走，寶珠會使玩家的攻擊力增加百分之十。
