1、取樣點不宜設在田邊、溝邊、路邊或肥堆邊；取樣時要首先清除表層的枯枝落葉，有植物生長的點位要首先除去植物及其根系。取樣現場要剔除礫石等異物。要注意及時清潔取樣工具，避免交叉汙染。
2、每個取樣點的取土深度及取樣量應均勻一致，土壤上層與下層的比例要相同。取樣器應垂直於地面入土，深度相同。用取土鏟取樣應先剷出一個耕層斷面，再平行於斷面下鏟取土。
3、測定微量元素的樣品必須用不鏽鋼取土器取樣。
4、測定重金屬的樣品，儘量用竹鏟、竹片直接採取樣品，或用鐵鏟、土鑽挖掘後，用竹片颳去與金屬取樣器接觸的部分，再用竹片採取樣品。對於汙染土壤的樣品，要根據汙染物的性質採取相應的防護措施，避免與人身體的直接接觸。
5、採集揮發性、半揮發性有機物樣品時，要防止待測物質揮發，注意樣品滿瓶不留空隙，低溫運輸和儲存。
