鄂爾齊斯河：發源於阿爾泰山南麓的加勒格孜嘎峰，是我國唯一入北冰洋水系的外流河，源流高程3100米，全長2969公里，自東向西流，原因是該河位於阿爾泰山南坡山前地帶與準噶爾盆地北緣，由於盆地從東南向西北傾斜，所以額爾齊斯河流域沿著東南——西北斷裂線，流出國境，它橫穿阿勒泰流入哈薩克境內的齋桑湖，下游稱鄂比河，在哈薩克注入北冰洋。
伊犁河：是新疆水量最大的河流，上游為特克斯河、鞏乃斯河和喀什河，在雅瑪圖匯合後稱為伊犁河，流經伊寧縣、伊寧市、察布查爾錫伯自治縣和霍城縣境，至國界同霍爾果斯河匯合後，注入哈薩克境內的巴爾喀什湖，它是我國唯一由東向西流入哈薩克的河流。
