1、培養方向不同。
軍校的最高學府是國防大學，該校著重培養部隊高階將領。從這裡走出去的高階指揮官們，將是未來戰爭的引領與最高指揮者。
而士官院校教育，招收國中以上文化程度的優秀士兵，實施系統的職業培訓，分別完成相應專業技術的技能訓練，畢業後從事各種技術裝備操作使用、維修保養和醫療護理工作。
2、收費標準不同。
上軍校是免費的，國家會負擔上學的花費！軍校每年從部隊和地方按比例招生，地方入校即入伍，享受軍人待遇，在校期間一切學習生活費用由國家支付。代表院校有國防科技大學、解放軍資訊工程大學等，順利畢業後工作由學校根據專業和各大軍區需要分配，去向涉及海陸空三軍。
但是士官學校部分是免費的，也有收費的，具體收費標準不同。
3、待遇不同
軍校生是指根據軍隊建設需要，由軍隊院校從參加國家統一招生考試錄取或保送入學且畢業後由軍隊統一分配的學生。它屬於現役軍人，發放的證件照片是穿軍裝，戴領花、肩章。持該證件可以享受現役軍人待遇。而士官學校發放的證件不穿軍裝或無領花、肩章，該證件相當於學生證，不享受現役軍人待遇
