生態系統結構主要包括組分結構、時空結構、營養結構。生態系統是由生物與非生物相互作用結合而成的結構有序的系統。生態系統結構是指生態系統各種成分在空間上和時間上相對有序穩定狀態。
組分結構是指生態系統中由不同生物型別或品種以及它們之間不同的數量組合關係所構成的系統結構。
時空結構也稱形態結構，是指各種生物成分或群落在空間上和時間上的不同配置和形態變化特徵，包括水平分佈上的鑲嵌性、垂直分佈上的成層性和時間上的發展演替特徵。
營養結構是指生態系統中生物與生物之間，生產者、消費者和分解者之間以食物營養為紐帶所形成的食物鏈和食物網，它是構成物質迴圈和能量轉化的主要途徑。
