軟化灶在大腦內形成，大腦內的軟化灶通常在出血或缺血性的病變之後，腦組織壞死、軟化，形成外層囊性結構，內裡是腦脊液填充的軟化灶的表現。在CT上就會形成一個影像比較黑，低訊號的表現。形成腦軟化灶的原因，包括腦出血、腦梗塞、腦栓塞，還有腦部的外傷或腦炎等疾病形成的。軟化灶相當於這些疾病之後留下的一個疤痕，不能恢復。大部分的患者軟化灶形成之後，逐漸周圍的病變消散症狀會減輕，大腦會有一定的代償作用，取代已經軟化壞死的這一部分大腦功能，大部分是能夠痊癒或不留任何後遺症。有極少數的患者由於軟化灶的範圍廣，會遺留後遺症。
